NanoType

NanoTYPE™ — это анализ HLA-типирования с использованием технологии секвенирования третьего поколения от Oxford Nanopore Technologies (ONT). Набор содержит все необходимые реагенты для амплификации вашего образца и поставляется с нашим специализированным программным обеспечением для генотипирования NanoTYPER™. Набор был разработан для совмещения с быстрой подготовкой библиотеки штрихкодирования от ONT.

Все 11 локусов (HLA-A, B, C, DQA1, DQB1, DPA1, DPB1, DRB1 и DRB345) амплифицируются в одной мультиплексной ПЦР дальнего действия. Пользователь может выбрать один из 2 различных протоколов, либо для срочной типизации одной выборки, либо для нескольких образцов.

Простой рабочий процесс, быстрое время выполнения, длительные считывания и отсутствие капитальных вложений в прибор делают его идеальным основным или дополнительным методом в вашей лаборатории.

Типизация на основе нанопор:

Компания Oxford Nanopore разработала новое поколение сенсорной технологии, которая использует нанопоры, встроенные в высокотехнологичную электронику, для выполнения точного молекулярного анализа. Когда фрагмент ДНК попадает в нанопору, каждое основание ДНК разрушает электрическое поле с определенной сигнатурой и может быть использовано в качестве детектора одной молекулы. Деконволюция электрического сигнала выполняется с помощью basecaller, преобразующего электрический сигнал в последовательность ДНК с выходным форматом FASTQ. Этот файл FASTQ затем импортируется в программное обеспечение NanoTYPER для генотипирования. Одним из основных преимуществ нанопорового секвенирования является длинное чтение, облегчающее фазирование даже удаленных друг от друга SNP, что приводит к меньшему количеству неоднозначностей.